فلز مولیبدن به حالت آزاد در طبیعت وجود ندارد. کانی اصلی مولیبدن مولیبدنیت (دی سولفید مولیبدن، MoS2) است.
ذخایر مولیبدن روی زمین اندک است، محتوای آن فقط 0.001% وزن پوسته زمین است و کل ذخایر سنگ معدن مولیبدن حدود 15 میلیون تن است که عمدتاً در ایالات متحده توزیع می شود. چین، شیلی، روسیه، کانادا و سایر کشورها. ذخایر اثبات شده فلز مولیبدن چین 1.72 میلیون تن و ذخایر اساسی آن 3.43 میلیون تن است که پس از ایالات متحده در رتبه دوم جهان قرار دارد. سنگ معدن مولیبدن در چهار استان شانشی، هنان، جیلین و لیائونینگ متمرکز است.
